近年来，随着科学技术的迅猛发展和新兴生物工程的开发，已经有越来越多的微生物，在农业、采矿、冶金、能源、轻工和环保等众多领域，得到了广泛的应用，使以往被人们所深恶痛绝的细菌化害为利。
日本农林水产省北陆农业试验场的技术人员，从细菌中筛选出一种能除草的菌种，这种细菌以孢子的方式附在杂草上，并迅速繁殖，导致杂草枯萎死亡。这种除草菌还能感染杂草的地下茎，使其不能再抽芽生长。经实际使用证实，用细菌除草比使用化学除草剂安全、方便、成本低，而且不会造成环境污染。美国奥克兰的遗传科学公司的研究人员，采用遗传工程方法，在实验室里使自然界里的一种细菌变性后获得一种防冻的细菌。这种细菌能防止霜冻对水果和块茎作物的冻害。他们在室外0.4公顷草莓田里，进行作物防冻细菌喷洒试验，结果表明，这种细菌可使作物在温度降至零下1摄氏度时不受冻害，而且对环境无不利影响。
然而，使人们感到更为有趣的是，加拿大科学家前不久研究出一种利用微生物开采黄金的技术。他们用一种称为氧化铁硫杆菌的微生物，来处理含金的硫黄岩石。这种氧化铁硫杆菌以硫作为能源，来破坏含硫岩石的结构。采用此法冶炼黄金，几乎能将矿石中的黄金百分之百地提取出来。澳大利亚科研人员，在昆士兰州的油井试验微生物增强采油法，也卓有成效。这种采油法，主要用来采集深匿在油井的岩石毛细缝中的石油。据统计，深匿在岩石缝中的石油，在全世界油井含量中的比例高达2/3。为了把这部分宝贵的能源开发出来，他们利用油井中天然存在的细菌，来破坏岩隙石油的表面张力，从而使石油顺利地流出来。这在一定的意义上来讲，细菌也为解决全球面临的石化能源的日益枯竭做出了贡献。
澳大利亚研究人员为便于开采地下煤田，防止瓦斯爆炸，利用细菌来减少甲烷气体的发生已获成功。科学家在地下煤井的墙壁上，移植大量的细菌，这种细菌以甲烷气体作为唯一的养料而生存，这样，只要煤井表面保持潮湿，便能减少瓦斯的含量，从而提高了矿井的安全性。
近年来，各国科技人员在微生物利用方面的研究，相继取得了突破，结出了累累硕果。美国科学家发现了一种能消化各类纤维素的嗜热细菌，如果让它们消化废纸，便可生产出葡萄糖。试验表明，每100公斤废纸，就可以生产50公斤糖。美国已建成一座大型制糖厂，用这种细菌每月能将100吨废纸加工为糖。
在解决环境污染问题方面，微生物也同样能发挥其积极作用。德国科学家研究出一种用细菌净化污水的方法，并在慕尼黑附近新建了一座污水净化厂。这种细菌可不停地吞食碳化物和蛋白质，能清除污水中99%的有害物质，为使“嘴馋”的细菌吞食时不致于喘不过气来，他们用巨大的压缩机不断地把氧气吹入水池内，每秒钟可净化5000升污水。美国科研人员培养出一种吞食煤中所含硫的细菌，从而为治理环境污染提供了条件。美国能源部认为，利用这种细菌除硫，经济可行，每吨煤仅花费12美元，而采用化学除硫每吨煤则需要费用50美元。
此外，微生物在日用品生产方面，也大有广阔的用武之地。日本九州大学农学部，用生物纸浆技术制出了优质新闻纸。该生物纸浆采用一种白色腐植菌，来分解木材中的木质素，省去了传统造纸工艺中的机械粉碎和化学处理过程。因此，可节约能源费用2/3。过去每生产一吨纸浆需耗电2000度，采用生物制浆法却只用700度电就足够了。用这种生物方法所制造的新闻纸，其抗拉强度也比一般新闻纸提高了两倍。日本科学家最近研制出一种用微生物产生电能的电池。其原理是，将两种细菌放入电池的特制糖浆中，由其中的一种细菌吞食糖浆产生醋酸和有机酸;而由另一种细菌使这些酸类产生氢气，这些氢气与电池中的物质发生化学反应，从而产生电能。
